Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RTN4Q9NQC3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTN4Q9NQC3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms