Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NRIP3Q9NQ35 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms