Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9D4

ZNF408, Zinc finger protein 408, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF408Q9H9D4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF408Q9H9D4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF408Q9H9D4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF408Q9H9D4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF408Q9H9D4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF408Q9H9D4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF408Q9H9D4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF408Q9H9D4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF408Q9H9D4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF408Q9H9D4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF408Q9H9D4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF408Q9H9D4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF408Q9H9D4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF408Q9H9D4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF408Q9H9D4 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF408Q9H9D4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF408Q9H9D4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF408Q9H9D4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF408Q9H9D4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF408Q9H9D4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF408Q9H9D4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF408Q9H9D4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF408Q9H9D4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF408Q9H9D4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF408Q9H9D4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF408Q9H9D4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF408Q9H9D4 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF408Q9H9D4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF408Q9H9D4 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF408Q9H9D4 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF408Q9H9D4 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF408Q9H9D4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF408Q9H9D4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF408Q9H9D4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF408Q9H9D4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF408Q9H9D4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF408Q9H9D4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF408Q9H9D4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF408Q9H9D4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF408Q9H9D4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF408Q9H9D4 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms