Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SCAF1Q9H7N4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 AC073575.1-201ENST00000551125 596 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCAF1Q9H7N4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms