Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TDRD3Q9H7E2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms