Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTDSP1Q9GZU7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms