Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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