Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVV2

FNDC11, Fibronectin type III domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC11Q9BVV2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms