Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PBDC1Q9BVG4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms