Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms