Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms