Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms