Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NLRP3Q96P20 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLRP3Q96P20 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms