Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
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SAMD8Q96LT4 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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SAMD8Q96LT4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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SAMD8Q96LT4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SAMD8Q96LT4 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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