Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPGRIP1Q96KN7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPGRIP1Q96KN7 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RPGRIP1Q96KN7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPGRIP1Q96KN7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPGRIP1Q96KN7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPGRIP1Q96KN7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPGRIP1Q96KN7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPGRIP1Q96KN7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPGRIP1Q96KN7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPGRIP1Q96KN7 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
RPGRIP1Q96KN7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RPGRIP1Q96KN7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPGRIP1Q96KN7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms