Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TPD52L3Q96J77 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPD52L3Q96J77 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms