Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC34Q96HJ3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms