Protein–RNA interactions for Protein: Q96FC9

DDX11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX11Q96FC9 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DDX11Q96FC9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms