Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms