Protein–RNA interactions for Protein: Q96E39

RBMXL1, RNA binding motif protein, X-linked-like-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBMXL1Q96E39 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBMXL1Q96E39 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms