Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UTP4Q969X6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UTP4Q969X6 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms