Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTLL11Q8NHH1 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms