Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN3

TMEM87A, Transmembrane protein 87A, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87AQ8NBN3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM87AQ8NBN3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms