Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPAP2Q8IXW5 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPAP2Q8IXW5 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms