Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC83Q8IWF9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC83Q8IWF9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms