Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMUB2Q71RG4 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms