Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BBS12Q6ZW61 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BBS12Q6ZW61 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms