Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYDE1Q6ZW31 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYDE1Q6ZW31 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms