Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQN7

SLCO4C1, Solute carrier organic anion transporter family member 4C1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO4C1Q6ZQN7 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLCO4C1Q6ZQN7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms