Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NFXL1Q6ZNB6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFXL1Q6ZNB6 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms