Protein–RNA interactions for Protein: Q6W349

LINC00575, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00575, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00575Q6W349 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00575Q6W349 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms