Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXD4L3Q6VB84 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms