Protein–RNA interactions for Protein: Q6R6M4

USP17L2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L2Q6R6M4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP17L2Q6R6M4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP17L2Q6R6M4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP17L2Q6R6M4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L2Q6R6M4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L2Q6R6M4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms