Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KCNIP4Q6PIL6 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCNIP4Q6PIL6 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms