Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRNP1Q6NT89 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TRNP1Q6NT89 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms