Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NANOGP8Q6NSW7 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms