Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALS2CLQ60I27 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms