Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF20Q5VTR2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms