Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZQ8

CELF3, CUGBP Elav-like family member 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF3Q5SZQ8 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CELF3Q5SZQ8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CELF3Q5SZQ8 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms