Protein–RNA interactions for Protein: Q49MI3

CERKL, Ceramide kinase-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERKLQ49MI3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CERKLQ49MI3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CERKLQ49MI3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CERKLQ49MI3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CERKLQ49MI3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CERKLQ49MI3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CERKLQ49MI3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CERKLQ49MI3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CERKLQ49MI3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CERKLQ49MI3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CERKLQ49MI3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CERKLQ49MI3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CERKLQ49MI3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CERKLQ49MI3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CERKLQ49MI3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CERKLQ49MI3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CERKLQ49MI3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CERKLQ49MI3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CERKLQ49MI3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CERKLQ49MI3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CERKLQ49MI3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CERKLQ49MI3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CERKLQ49MI3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CERKLQ49MI3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CERKLQ49MI3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CERKLQ49MI3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CERKLQ49MI3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CERKLQ49MI3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CERKLQ49MI3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CERKLQ49MI3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CERKLQ49MI3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CERKLQ49MI3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CERKLQ49MI3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CERKLQ49MI3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CERKLQ49MI3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CERKLQ49MI3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CERKLQ49MI3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CERKLQ49MI3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CERKLQ49MI3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CERKLQ49MI3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CERKLQ49MI3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CERKLQ49MI3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CERKLQ49MI3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CERKLQ49MI3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CERKLQ49MI3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CERKLQ49MI3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CERKLQ49MI3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CERKLQ49MI3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CERKLQ49MI3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms