Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PPP1R3AQ16821 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms