Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTN1Q16799 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
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