Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CLPPQ16740 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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