Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC18A3Q16572 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
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