Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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SNAPC1Q16533 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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SNAPC1Q16533 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNAPC1Q16533 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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