Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms