Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIK4Q16099 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms