Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USF2Q15853 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USF2Q15853 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USF2Q15853 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USF2Q15853 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USF2Q15853 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USF2Q15853 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
USF2Q15853 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USF2Q15853 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USF2Q15853 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USF2Q15853 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USF2Q15853 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USF2Q15853 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USF2Q15853 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USF2Q15853 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USF2Q15853 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USF2Q15853 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USF2Q15853 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USF2Q15853 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USF2Q15853 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
USF2Q15853 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USF2Q15853 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USF2Q15853 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USF2Q15853 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USF2Q15853 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USF2Q15853 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USF2Q15853 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USF2Q15853 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USF2Q15853 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USF2Q15853 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USF2Q15853 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USF2Q15853 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USF2Q15853 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USF2Q15853 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USF2Q15853 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USF2Q15853 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USF2Q15853 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USF2Q15853 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USF2Q15853 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USF2Q15853 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USF2Q15853 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USF2Q15853 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USF2Q15853 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USF2Q15853 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
USF2Q15853 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USF2Q15853 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USF2Q15853 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USF2Q15853 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USF2Q15853 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USF2Q15853 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USF2Q15853 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
USF2Q15853 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USF2Q15853 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USF2Q15853 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USF2Q15853 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USF2Q15853 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USF2Q15853 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USF2Q15853 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USF2Q15853 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USF2Q15853 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USF2Q15853 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
USF2Q15853 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
USF2Q15853 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
USF2Q15853 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
USF2Q15853 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
USF2Q15853 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
USF2Q15853 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USF2Q15853 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USF2Q15853 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USF2Q15853 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USF2Q15853 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USF2Q15853 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USF2Q15853 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USF2Q15853 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USF2Q15853 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USF2Q15853 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USF2Q15853 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USF2Q15853 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USF2Q15853 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USF2Q15853 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USF2Q15853 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USF2Q15853 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USF2Q15853 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USF2Q15853 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USF2Q15853 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USF2Q15853 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USF2Q15853 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
USF2Q15853 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USF2Q15853 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USF2Q15853 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USF2Q15853 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USF2Q15853 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USF2Q15853 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USF2Q15853 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USF2Q15853 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USF2Q15853 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USF2Q15853 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USF2Q15853 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USF2Q15853 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USF2Q15853 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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