Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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EFNB3Q15768 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNB3Q15768 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNB3Q15768 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNB3Q15768 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFNB3Q15768 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
EFNB3Q15768 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
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EFNB3Q15768 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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EFNB3Q15768 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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EFNB3Q15768 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
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EFNB3Q15768 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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EFNB3Q15768 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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EFNB3Q15768 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNB3Q15768 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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