Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRADDQ15628 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRADDQ15628 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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